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1999 bringt LEGO als Lizenznehmer von Lucasfilm Ltd. Star Wars Modelle zu den ersten drei sowie dem neuesten Film heraus, u.a. ein X-Wing Fighter, ein Y-Wing Fighter und ein Podrace-Set. Dies ist das erste Mal, das keine Eigenentwürfe herausgebracht werden, sondern auf Lizenz produziert wird. Die bisherige Raumfahrt-Reihe wird dadurch weiter reduziert (bis auf die Insectoid-Reihe), und verschwindet im Folgejahr schließlich gänzlich.

Die Stadt-Reihe wird ergänzt um neue Verkehrsschilder. Diese Reihe wird umbenannt und nennt sich fortan "City".

Das Burg-Programm wird abgelöst von der neuen Ninja-Reihe, die mit insgesamt 7 Kästen erscheint. Sie beinhaltet u.a. einen Shogun-Palast, eine Brücke und ein Ninjaversteck.

Neu eingeführt wird die Reihe Space Port, ein Thema, das bereits in ähnlicher Form 1995 im Rahmen der Stadt-Reihe erschien.

Eine weitere Neuheit ist die Reihe Rock Raiders, eine unterirdische Welt, in der Bergleute nach Kristallen suchen und gegen Rockmonster kämpfen müssen.

Die Eisenbahn-Reihe wird u.a. ergänzt um einen neuen Bahnhof, einen Container-Verladekran und einen neuen Personen- und Autoreisezug.

Die Belville-Reihe bekommt eine neue Märchenwelt mit einem großen Märchenschloß hinzu.

Im Rahmen des Technic-Programms erscheint mit Slizer eine neue Action-Serie.

Mindstorms erscheint, ein Programm mit einem "intelligenten" Legostein, der über den PC programmiert werden kann und so den Bau computergesteuerter Modelle ermöglicht.

Innerhalb des DUPLO Programms erscheint eine neue Spielwelt rund um Winnie Pooh.

Es erscheinen vier weitere CD-ROMs: LEGO Friends, LEGOLAND (zum Gestalten eines Freizeitparks), LEGO Racers (ein Autorennspiel) und LEGO Rock Raiders (ein 3D Strategiespiel in der neu eingeführten Rock Raiders-Welt).